该境界似乎与禅宗之境界有着巨大的差距。但在《坛经》之末，名曰“付嘱品第十”，其中深载了惠能大师对弟子们遗言时的衷心教导。在自知时日无多的生命尽头，他详细阐述了“三科”与“三十六对”的深奥道理。
“三科”强调自我本性的包容性，即自我之中含藏万法，一切事物与现象皆被其涵盖。而“三十六对”则贯通了一切经法，若能理解并运用此法，便能够贯通佛法与经典，同时避免陷入两个极端。其深奥之处实难完全领悟。
惠能大师不仅在佛法上做出了总结性的陈述，还在唐睿宗延和元年（712年）七月，命令弟子前往新州国恩寺督建其墓塔。次年夏末墓塔落成后，他召集，告知他们自己即将离世。他以佛法本性无生无灭的观念，为众人开示真假动静偈，以此来讲解修持上的动与静、真与假的哲理。
这偈的尾四句表明：此宗并无争执，争执即会失去道义；若执意与相逆，便容易迷失于生死之中。换言之，人们应避免过于执着，而应持有一种辩证通达的态度。对于我们凡人而言，这其中的奥妙难以完全理解。
听完偈语后，法海询问惠能大师在他灭度之后，衣法应传于何人。惠能回答说，他已经将他的教法记录在《法宝坛经》中，并希望弟子们能够守护并传递此经，以此为。他表示他不需要将衣钵传给特定的弟子，因为他对他们的信任与决心深感满意，他们已堪任大任。
公元713年的唐玄宗先天二年八月初三，惠能大师在国恩寺用斋后，与子道别。这是一个诀别的时刻，法海再次询问大师留下何种教法以令后代迷途之人得见佛性。惠能大师告诉弟子们，若要识见众生及佛性，需识见自心的众生及佛性；若不识见众生，则需在无数劫中寻佛。
惠能继续开示道：“一旦自性觉悟，众生即为佛；自性迷惑时，佛即为众生。自性平等时，众生即是佛；自性邪险时，佛仍为众生。保持一心平直即是众生成佛之路。我心中自有佛，那佛即是真我之佛。若无佛心，又何处寻求？你们自心即佛，无需犹豫。”这段话强调了自性的重要性，肯定了子心中皆有佛性，有能力弘扬佛法。
惠能大师在临终前仍对弟子们传授佛法意犹未尽。他留下了一首偈语：“静默不造善业，逍遥不行。宁静无见无闻，坦荡心无挂碍。”说完后，“他端坐至三更时分，忽然对门人说：我走了！安详离世。”
《坛经》在记载惠能大师圆寂的瞬间时充满了美好的祈愿与真挚的悲情：“那一刻异香满室、白虹贯地、林木变白、哀鸣。”这位禅宗大师虽然洞察并看透了一切，但在临终前仍念念不忘对弟子们的嘱托。
生命的终结并非意味着一切的结束。惠能大师的如同一盏明灯，指引着后世弟子们在佛法的道路上不断前行。