针对您单位签订的工程施工合同及涉及到的吸粪车采购问题，我们来进行详细解析。
需要明确的是，根据我国现行的税法规定，混合销售行为指的是一项销售行为同时涉及服务与货物的行为。根据《营业税改征试点实施办法》的相关规定，对于混合销售行为，其税务处理方式需要根据企业的经营主业来确定。
在您单位的合同中，虽然包含了采购吸粪车这一部分，但主要的业务是工程施工服务。这两部分应当被视为两个独立的交易，而非混合销售行为。对于工程施工服务部分，您已全额开具工程款，适用9%的销项税。而对于购车部分，虽然产权暂时在您单位户头，但作为施工成本入账，不计入固定资产。在车辆移交给甲方时，应当按照相关规定以13%的税率开具并缴纳。
关于税务部门要求您单位再次进行视同销售的问题，这可能是因为车辆产权虽在您单位，但实际使用于工程施工中，其价值随工程价值的实现而转移。在税务上需要对这一部分进行相应的处理。
至于您提问的车辆与工程中包含的材料款有何不同的问题，主要在于其性质和用途的不同。材料款通常是用于工程建设的原材料费用，而车辆则是一种设备或工具，用于工程施工过程中的运输或作业。在税务处理上，材料款通常与工程施工服务一同视为混合销售行为，而车辆则需根据其购买、使用及移交等具体情况进行税务处理。
希望以上解析能帮您更好地理解您单位在工程施工合同中的税务处理问题。如有任何疑问或需要进一步的解释，请随时与我们联系。